Bonnie Hunt grandit à Chicago et y trouve son premier emploi d'infirmière dans le pavillon des cancéreux au Northwestern Memorial Hospital. Mais parallèlement, elle goûte déjà à la comédie dans une troupe de théâtre amateure, qui se produit au Bob's Bar.En 1988, elle obtient un rôle court mais marquant dans Rain Man : elle est "la serveuse aux cures dents". Dès 1992, grâce à Beethoven, elle trouve son emploi, celui de la mère de famille modèle, capable de mener en même temps une carrière professionnelle épanouie. Un rôle qu'elle reprend en 1993 dans Beethoven 2.Préférant les films familiaux, elle participe ainsi aux aventures de Jumanji (1995) et joue la grande soeur protectrice de Marisa Tomei dans Only you (1994) et celle de Renée Zellweger dans Jerry Maguire (1996).Elle aborde un registre plus dramatique avec La Ligne verte (1999), adapté d'une nouvelle de Stephen King. La même année, elle participe au drame L'Ombre d'un soupçon. Fidèle à son implication dans des projets grand public, elle prête sa voix à Rosie dans 1001 Pattes (1998), et à Flint dans Monstres & Cie (2001). 13 à la douzaine (2002) lui permet de poursuivre dans la lignée des comédies symptahiques pour (grandes) familles : elle est Kate Baker, mère de 12 enfants et engagée dans une vie professionnelle très active.Elle passe à la réalisation en 2000, pour la comédie romantique Droit au coeur, où Minnie Driver et David Duchovny se donnent la réplique. Elle y interprète également une précieuse confidente - mère d'une famille nombreuse.
